교회음악과정은 교회와 음악이라는 두 개의 학문을 하나로 합친 것이 특징이다.

이러한 신학(神學, theology)의 속성과 예술(藝術, art)의 속성이 하나의 명칭 아래 각각의 학문적 독립성이 주장되는 복합적인 학문이기 때문에 교회음악은 신학적인 배경의 교회와 예술적인 배경의 음악을 총합하여 하나로 개념화해야 학문이다.

그러므로 서울신학의 교회음악과정의 교육은 대표적인 교회음악 주제인 찬송가학, 예배와 음악은 물론이거니와 음악과 신학, 교회음악문헌 및 교회음악사, 교회음악교육, 교회음악행정, 교회음악목회, 성경상의 교회음악 등을 폭넓게 강의하며 악기교습과 성악, 지휘교습을 병행하고 있다.